Музей расположен по адресу Шпалерная улица, дом 56. Основная экспозиция музея находится в водонапорной башне, построенной в кирпичном стиле в 1859-1863 годах архитектором И. А. Мерцем. Водонапорная башня входит в комплекс бывшей главной станции Санкт-Петербургских городских водопроводов и является памятником архитектуры регионального значения. Экспонаты, макеты, инсталляции, мультимедийные экспозиции музейного комплекса «Вселенная Воды» рассказывают об истории, современном состоянии и перспективах водоснабжения и водоотведения города, использовании воды в быту, состоянии водных ресурсов.